Diagenode

エピジェネティクス・DNAメチル化

DNAメチル化研究のための完全打開策

Diagenodeは、DNAメチル化の分野の経験者、未経験者どちらの方でも、実験の一貫性のあるデータを確保しながら、できるだけシンプルかつ便利な実験にするために必要なすべてをご提供いたします。Diagenodeは、超音波装置、試薬キット、高品質の抗体、ハイスループットの自動化機能を備えており、特定のDNAメチル化解析のすべての要件に対応します。

DNAメチル化は最初に発見されたエピジェネティクスマークであり、エピジェネティクススにおいて最も広く研究されているトピックです。生体内でDNAは複製後にメチル化され、刷り込みされた遺伝子、X染色体不活性化および癌細胞における腫瘍抑制遺伝子サイレンシングの調節を含む多くの生物学的過程に関与します。.メチル化は、多くの場合プロモーター領域の上流にあるDNAのシトシン - グアニンが豊富な領域(CpGアイランド)で発生します。


  • 参照
    エピジェネティクス規制でDNAの唯一の変形として、5-メチルシトシン(5-mC)が最も有名です。 しかし2009年に、Kriaucionisは第2のメチル化シトシン、5-ヒドロキシメチルシトシン(5-hmC)を発見しました。いわゆる6番目の塩基は、オキシゲナーゼのTET類による5-メチルシトシン(5-mC)の5-ヒドロキシメチルシトシンへの酵素的変換によって生成されます。初期の報告では、DNAを脱メチル化して5-mCをシトシンに変換する新しい経路において、5-hmCが活性脱メチル化の中間体である可能性が示唆されています。最近の検証結果は、ヒドロキシメチル基のさらなる酸化がホルミルまたはカルボキシル基に導き、次いで脱ホルミル化または脱カルボキシル化のいずれかをもたらすことを示唆するこの仮説を裏付けています。5-ホルミルシトシン(5-fC)および5-カルボキシシトシン(5-caC)のホルミルおよびカルボキシル基は、塩基の除去なしに酵素的に除去に成功しました。


主なDNAメチル化テクノロジー

DNAメチル化を検討する主な三つのアプローチの概要

  1. 亜硫酸水素塩による化学修飾 - 亜硫酸塩変換
  2. メチル化DNAの濃縮(MeDIPおよびMBDを含む)
  3. メチル化感受性または依存性制限酵素処理

 

Description Features
Bisulfite conversion Chemical conversion of unmethylated cytosine to uracil. Methylated cytosines are protected from this conversion allowing to determine DNA methylation at single nucleotide resolution.
  • Single nucleotide resolution
  • Quantitative analysis - methylation rate (%)
  • Gold standard and well studied
  • Compatible with automation
Methylated DNA enrichment (Hydroxy-)Methylated DNA is enriched by using specific antibodies (hMeDIP or MeDIP) or proteins (MBD) that specifically bind methylated CpG sites in fragmented genomic DNA.
  • Resolution depends on the fragment size of the enriched methylated DNA (300 bp)
  • Qualitative analysis
  • Compatible with automation
Restriction enzyme-based digestion Use of (hydroxy)methylation-sensitive or (hydroxy)methylation-dependent restriction enzymes for DNA methylation analysis at specific sites.
  • Determination of methylation status is limited by the enzyme recognition site
  • Easy to use

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