Diagenode

エピジェネティクス・クロマチン解析

ChIP-seq

検出方法(ChIP-seq)としてハイスループットシーケンシングと結合したクロマチン免疫沈降(ChIP)は、今やエピゲノム研究、すなわちゲノム規模でのタンパク質-DNA相互作用の研究において主要な方法の1つされています。また、この技術は現在、細胞分化、腫瘍抑制遺伝子のサイレンシング、および遺伝子発現に対するヒストン修飾の効果を含む様々なライフサイエンス分野で使用されています。
ChIP-seqワークフロー


  1. クロマチン調製 : DNAへのヒストンまたは転写因子などのクロマチン結合タンパク質の固定(架橋)に続いて細胞溶解。
  2. クロマチン断片化 :  超音波処理による所望の断片サイズ(100500bp)までのクロマチンの断片化
  3. クロマチン免疫沈降 : 目的のヒストンまたは転写因子に対する特定のChIP級抗体を用いたタンパク質-DNA複合体の捕捉
  4. DNA精製: クロマチン逆架橋および溶出後の精製
  5. NGSライブラリ調整 : アダプターを結紮してIP化されたサンプルを増幅
  6. バイオインフォマティクス分析 : リードフィルタリングとトリミング、リードによるアライメント、エンリチッメントによるピークコール、QCメトリック、マルチサンプルの相互比較などを実行します。

さらに詳しく

当社の完全なChIPキットを選択頂くか、個別で抗体、バッファー、ビーズ、クロマチン断片および精製試薬から必要なものを選択頂けます。ChIP Kit Customizerを使用すると、検証済みのChIPキットから必要なアイテムを自由に選択できます。

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