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エピジェネティクス受託サービス

クロマチンプロファイリングサービス

低価格で優れたChIP-seqデータを入手

プロモーション対象は以下の通りです：

マーク	対応生体	対応サンプル
H3K4me3 H3K4me1 H3K27me3 H3K27ac CTCF	ヒトマウスラット	細胞組織 (要相談)

プロジェクトについて教えてください

プロモーションサービスパッケージ内容
- Shearing optimization (two shearing conditions tested)
- Chromatin immunoprecipitation
- Validation by qPCR on a positive and a negative control region
- Library preparation on ChIP sample and input
- Sequencing (average of 30-50M raw reads, SE50 on Illumina HiSeq3000/4000)
- Bioinformatic analysis including:
  - QC of raw reads with trimming and filtering if necessary
  - Filtering of black-listed regions
  - Alignment of quality filtered reads to reference genome
  - Removal of multimapping reads and PCR duplicates to provide uniquely aligned reads
  - Peak calling that identifies the regions with enrichment in the IP sample normalized to the input

クロマチンは、ＤＮＡ、ヒストンおよび非ヒストンタンパク質から成り、クロマチンを形成する際に、ヒストンはDNAにしっかりと包まれています。一般に、より高度に濃縮されたクロマチンは、転写因子および他のＤＮＡ結合タンパク質よりもDNAにアクセスしにくいため、その結果、遺伝子発現に影響を与えます。遺伝子発現の調節を理解するためには、ヒストンと転写因子の役割を理解する事が重要です。ＣｈＩＰ − ｓｅｑ解析を使用して、疾患または薬物治療に応答した遺伝子発現の調節の理解のために、ヒストン修飾および転写因子結合をゲノムワイドにプロファイルすることが可能です。 DiagenodeのEpigenomic Profiling Servicesは、ChIP-seqおよびATAC-seqを通じて、さまざまなクロマチン解析オプションを提供しています。

ATAC-seq: closed/open chromatin regions

全ゲノムにおけるクロマチンのアクセシビリティを研究。オープンクロマチン部位、プロモーター、エンハンサー、及びインシュレーターなどの活性調節エレメントを同定します。

ヌクレオソームの位置付け
TFフットプリント推論

細胞数10,000個でのChIP-seq/ChIP-qPCR ヒストン修飾

ヒストン翻訳後修飾は、遺伝子発現の調節に関与し、（活性プロモーターおよびエンハンサー分析のような）制御エレメント及びそれらの相互作用タンパク質の研究を必要とします。転写調節を理解するためにChIP-seq解析によるゲノム全体のヒストン修飾のプロファイリングします。

活性プロモータープロファイリング: H3K4me3濃縮
不活性プロモータープロファイリング: H3K27me3濃縮
エンハンサープロファイリング: 制御領域におけるH3K4me1およびH3K27acの濃縮
活性遺伝子本体: H3K36me3

ChIP-seq/ChIP-qPCR 転写因子

多数の転写因子のChIP-seq解析による転写因子結合の影響を調べる：

CTCF: 転写リプレッサー及びインシュレーター活性
p300/CBP: ヒストンアセチルトランスフェラーゼ
Pol II、p53など
エピジェネティクスwriters, readers, erasers
核レセプター
腫瘍サプレッサー遺伝子

カステムNGSサービス

ピコグラムからの低インプットライブラリー
特定の解析
完全にカスタマイズされたプロジェクト

製品

カタログ番号	製品	フォーマット
G02060000	ATAC-seq 受託サービス (Assay for Transposase-Accessible Chromatin) ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing)は、ゲノムワイドなクロマチンアクセシビリティの査定を可能にします。この技術は、トランスポゼースを利用してオープンクロマチンを切断すると同時に、増幅及び配列決定のアダプター...		Get a quote You are about to request a quote for our epigenomics services. Fill out the form below and we will be in touch with you very soon. All * fields are mandatory Service Information Which services are you interested in? ChIP-seq ATAC-seq RRBS WGBS MeDIP-seq Targeted DNA methylation analysis Infinium EPIC Array Infinium Mouse Methylation Array RNA-seq Bioinformatics Data mining Sample species Total number of samples (including replicates) Contact Information First name ^* Last name ^* Company ^* Phone number City Country ^* State Email ^* Email verification^* Project ×
G02010000	ChIP-seq/ChIP-qPCR プロファイリングサービス ChIP-seqをもっと身近に：豊富なフルサービス経験と実績：IHEC-BLUEPRINT Epigenome Consortiaの公式パートナーであり、ChIP-seqにおける10年の実績と経験カスタマイズ可能なサポートプラン専門チームによるプロジェクト調整 ...		Get a quote You are about to request a quote for our epigenomics services. Fill out the form below and we will be in touch with you very soon. All * fields are mandatory Service Information Which services are you interested in? ChIP-seq ATAC-seq RRBS WGBS MeDIP-seq Targeted DNA methylation analysis Infinium EPIC Array Infinium Mouse Methylation Array RNA-seq Bioinformatics Data mining Sample species Total number of samples (including replicates) Contact Information First name ^* Last name ^* Company ^* Phone number City Country ^* State Email ^* Email verification^* Project ×
G02100000	データマイニングサービス New! ユニークなエピジェネティックなデータ洞察に（AI）を使用したデータマイニング Watch the webinar to gain insights on how data mining can be applied for epigenetics applications ...	Custom	Get a quote You are about to request a quote for データマイニングサービス. Fill out the form below and we will be in touch with you very soon. All * fields are mandatory Contact Information First name ^* Last name ^* Company ^* Phone number City Country ^* State Email ^* Email verification^* Comment ×

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