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MeDIP-seq (Methylated DNA IP Sequencing) 受託サービス

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Catalog Number
Format
G02050000

5mCゲノム全体の研究に、メチル化DNA免疫沈降シーケンシング(MeDIP-Seq)を行います。このアッセイでは、免疫沈降の際の5-mCに対する特異的抗体を利用して、メチル化DNA領域を捕捉します。免疫沈降画分中のメチル化DNAの濃縮は、個々の領域のメチル化状態を評価する配列決定によって確定します。

DNAメチル化プロファイルの定性分析に優れた方法

    • 100〜500 bpの解像度
    • 低密度および繰り返し頻度の高い領域での5mCカバレッジ
    • 特異性が高く、偏りの少ない配列などに影響を受けない抗体ベースのアプローチ
    • 専門の科学者がハイタッチコミュニケーションで顧客プロジェクトを管理
    • 包括的なサービス - 免疫沈降、ライブラリーの調製、配列決定、分析

 

  • 詳細

    MeDIP sequencing services include:

    QC of the genomic DNA

    • Measurement of DNA concentration
    • Assessment of  DNA quality

    Preparation of MeDIP-seq libraries*

    • gDNA shearing on Bioruptor® Pico  
    • Library preparation
    • Immunoprecipitation of methylated DNA using Abs specific to 5-mC
    • Library amplification and clean-up  
    • QC of the MeDIP-seq libraries

    Deep sequencing

    • Samples are sequencedon an Illumina platform  
    • Single-read or paired-end  
    • 50bp to 150bp read length  
    • Greater than or equal to 50M reads per sample
    • Coverage to be defined with customer

    *Full protocol details can be viewed in the MagMeDIP-seq Package manual

  • バイオインフォマティック解析

    Customized bioinformatic analysis on request

  •  資料
    Epigenomics Profiling Services FLYER
    Chromatin analysis DNA methylation services RNA-seq analysis
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