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Targeted DNA methylation 受託サービス

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カタログ番号
フォーマット
G02070000

Targeted DNA methylation 受託サービスは、ゲノム全体の既知の正確な位置でのシトシンメチル化の定量的研究を可能にします。関心領域の大きさに応じて、バイサルファイトパイロシーケンシング、バイサルファイトアンプリコンシーケンシング(BSAS)、およびプローブによるカスタムキャプチャーなどの数多くの方法論を用いることが可能です。これらの技術は、単一ヌクレオチド分解能で標的領域のメチル化状態を定量的に検出するために、バイサルファイト変換とその後のシーケンシングに共通の方法論を共有しています。

  • 詳細

    Targeted Bisulfite Sequencing Service will choose between two methodologies depending on the size of the region of interest:

    Workflow

    Description

    Region of interest

    PCR Enrichment

    • (gDNA shearing on Bioruptor Pico)
    • Bisulfite conversion
    • PCR primer design
    • PCR amplification optimization
    • Library preparation
    • QC of final libraries (DNA concentration, analysis of the profile)
    • Sequencing on Illumina platform
    • Several, long DNA regions
    • Total size up to 200kb

    Hybridization Capture

    • (gDNA shearing on Bioruptor Pico)
    • Bisulfite conversion
    • Library preparation
    • Capture probe design
    • Amplification optimization
    • QC of final libraries (DNA concentration, analysis of the profile)
    • Sequencing on Illumina platform
    • Large number of very long DNA regions
    • Total size between 0.2-100Mb
  • バイオインフォマティック解析

    Analysis

    Features

    Standard
    • FASTQ raw data
    • FASTQC quality control insights
    • Alignment of bisulfite sequencing data against reference genome
    • Methylation calling and extraction
    • Summary statistics
    Differential methylation analysis
    • Methylation level analysis
    • Differentially Methylated CpGs (DMCs) analysis
    • Differentially Methylated Regions (DMRs) analysis
    • Annotation of DMCs and DMRs for genomic regions (exons, introns, …) and for CpG island locations (islands, shores, shelves, ...)

  •  資料
    Epigenomics Profiling Services FLYER
    Chromatin analysis DNA methylation services RNA-seq analysis
    Download
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