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Infinium Methylation EPIC Array受託サービス

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カタログ番号
フォーマット
G02090000

Infinium MethylationEPIC Arrayは、バイサルファイト処理とIllumina®技術に基づくゲノムワイドのDNAメチル化解析技術です。これは、一塩基分解能を有するゲノム全体にわたる850,000を超えるヒトCpG位置のメチル化レベルの定量的な検出を可能にします。

バイサルファイトで処理すると、メチル化されたシトシン塩基は変化しませんが、メチル化されていないシトシン塩基はウラシルに変換されます。Infinium HD配列技術は、メチル化部位と非メチル化部位に対して各々に設計された部位特異的プローブを用いて、これらの分化した遺伝子座を調べます。調べられた遺伝子座のメチル化のレベルは、メチル化部位と非メチル化部位との蛍光シグナルの比を計算することによって決定されます。

包括的なゲノムワイドカバレッジのための優れた方法

  • 高いコストパフォーマンス、結果までの時間短縮
  • CpG、非CpG、及びCHH部位におけるメチル化部位の定量解析
  • 一塩基分解能で850,000を超えるヒトCpG位置
  • 異なるメチル化部位解析
  • 徹底したバイサルファイト変換、配列交配、および解析が含まれる包括的なサービス

  • 詳細
    EPIC Array Service

    End-to-end Array

    • Bisulfite conversion
    • QC of bisulfite conversion by Methylation-specific PCR (MSP) on 3 specific regions with known methylation status  
    • Whole genome amplification  
    • Array hybridization
    • Single base extension  
    • Array scanner 
  • バイオインフォマティック解析

    Analysis

    Features

    Standard

    Standard files provided:

    • Sample annotation
    • Variable annotation
    • Raw data (un-normalized β values and detection p-values)
    • Scanner output

    Differential methylation analysis

    Identification of differentially methylated CpGs between sample groups.

    Files provided:

    • Report with summary of differential methylation analysis and plots
    • File containing the differentially methylated CpGs and breakdown of those positions in regional analysis (CpG islands, shelves, shores and open sea)
    • File containing differential methylated regions (DMRs)

    Gene ontology terms analysis

    Enrichment analysis on gene sets. Gene Ontology terms that are overrepresented in differentially bound regions may indicate the underlying biological processes involved.

    Pathway analysis

    Identify biochemical pathways in which genes associated with differentially methylated regions (or individual differentially methylated CpGs) may be overrepresented.

  •  出版物

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