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次世代シーケンシング

DNA/RNA断片

近年の次世代シーケンシング（NGS）の進歩はゲノミクスや生物学に革命をもたらしました。この成長により、最適なサンプル調製、ゲノムライブラリー構築には欠かせない高度技術の要求、必要性がさらに高まっています。最適なライブラリー調製に最も重要な要因の一つは、シーケンシングされるDNAの品質です。まずは、DNAを効果的かつ一貫してシーケンシングプラットフォームに応じた適切な断片サイズに切断し、具体的で信頼できるNGS結果を実現する必要があります。 Picoruptor and Megaruptor®なら、次世代シーケンシングワークフローに不可欠な高サンプル収率、フラグメントサイズ、そして一貫性を実現できます。当社ガイドラインに沿って、DNAサイズに適したパラメーターを見つけてください： Picoruptor®でDNAシェアリング.

PicoruptorはDNAサイズ分布がプログラム可能で高度な再現性を持ちます。0.65（パネルA）または0.1 ml（パネルB）マイクロチューブを使用した実験例。パネルA：100μlの容量を用いて13サイクル後に200bp（13秒オン/オフ）。平均サイズ：204; CV％：1.89％） パネルB：10μlの容量を用いて、20サイクル後に200bp（30秒のON / OFF）。（平均サイズ215bp; CV％：6.6％）。 パネルAとB：ピークエレクトロフェログラム図。 パネルCとD：バーチャルゲル・ビュー。

短いフラグメントサイズのハイドロポーラスを使ったMegaruptor®による再現性があり短いDNA分布を行いました。これは2つの異なるDNA源と2種類の分析方法で、検証されています。 A：ラムダファージゲノムDNA（20ng /μl;150μl/サンプル）を多様な速度設定でせん断し、1％アガロースゲルで分析。 B：2および5kbの異なるソフトウェア設定でせん断されたヒトゲノムDNA（20ng /μl;150μl/試料）のBioanalyzerプロファイル。 3つの独立した実験を各設定に対して実行。（分離およびフラグメントサイジングのためにAgilent DNA 12000キットを使用）。

Megaruptor®による、長い断片サイズのハイドロポアを用いた15kb〜75kbフラグメントサイズのせん断を実証しました。 画像は、長い断片のハイドロポアでせん断されたヒトゲノムDNAのDNAサイズ分布を示します。 1％アガロースゲル中でパルスフィールドゲル電気泳動（PFGE）によりDNAを分析し、平均サイズのスミアをImage Lab 4.1ソフトウェアを用いて推定します。
*は未交換DNAを示します。

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